Cancer cell:基于肿瘤血小板的RNA测序精准诊断肿瘤新方法
2015-11-04 子非鱼 医生科研助手
近日,来自阿姆斯特丹自由大学的Myron G在《Cancer cell》发表的一篇文章提出,基于肿瘤血小板(Tumor-educated blood platelets,TEPs)的RNA测序可用于泛癌症分析、癌症类型的区分和肿瘤基因突变诊断。结果表明,血小板的RNA测序可以区分癌症患者与健康人,其准确率达到96%,也能区分六种原发肿瘤类型,其准确度达到71%,并能识别几种肿瘤中发现的基因改变。领
近日,来自阿姆斯特丹自由大学的Myron G在《Cancer cell》发表的一篇文章提出,基于肿瘤血小板(Tumor-educated blood platelets,TEPs)的RNA测序可用于泛癌症分析、癌症类型的区分和肿瘤基因突变诊断。结果表明,血小板的RNA测序可以区分癌症患者与健康人,其准确率达到96%,也能区分六种原发肿瘤类型,其准确度达到71%,并能识别几种肿瘤中发现的基因改变。领先于其他的液体活检,基于TEPs的RNA测序可以通过查明原发肿瘤的部位对癌症进行精确的诊断。
癌症的诊断主要有通过临床症状、放射学、生化检测、肿瘤组织病理分析,以及越来越受欢迎的分子诊断。肿瘤组织样本的分子分析已经成为一种潜在的癌症分类方法。因为局部组织活检,需要手术从肿瘤样本取样切片,这给患者带来很大的痛苦,也不能频繁进行。因此基于血液的“液体活检”,渐渐取代创伤性的组织活检,被搬上了癌症诊断的舞台,如目前大热的液体活检:基于细胞游离DNA和血液循环肿瘤DNA的检测等。
据报道,肿瘤血小板检测可以成为基于血液的癌症诊断方法。作为血液中第二丰富的细胞类型,血小板是由骨髓造血组织中的巨核细胞产生。多功能造血干细胞在造血组织中经过定向分化形成原始的巨核细胞,又进一步成为成熟的巨核细胞。成熟的巨核细胞膜表面形成许多凹陷,伸入胞质之中,相邻的凹陷细胞膜在凹陷深部相互融合,使巨核细胞部分胞质与母体分开。最后这些被细胞膜包围的与巨核细胞胞质分离开的成分脱离巨核细胞,经过骨髓造血组织中的血窦进入血液循环成为血小板。存在于外周血液循环中的血小板,在机体中起着止血和伤口愈合作用。
最近的研究指出,在肿瘤生长过程中,血小板已成为全身和局部反应的中心分子。体内外实验证明,肿瘤细胞能将(突变的)RNA转入血小板中。有研究者从神经胶质瘤和前列腺癌患者中抽取血小板发现了癌症相关的RNA生物标记物EGFRvIII 、PCA3等。
外界刺激如血小板表面受体的激活和脂多糖介导的血小板激活,甚至在癌细胞和肿瘤微环境的基质细胞和免疫细胞的刺激条件下,血小板的pre-mRNA能被剪接为成熟RNA,然后转化为功能性蛋白应对外部刺激。
研究表明血小板在体内肿瘤细胞的转移传播中发挥重要作用。肿瘤细胞能将(突变的)RNA转入血小板中,响应外部信号时血小板的特定pre-mRNAs发生剪接。TEPs可以检测出血小板所含的肿瘤源性RNA生物标志物,这使其成为具有潜在的癌症诊断功能的诊断方法。在这项研究中,Myron G等描述了血小板mRNA在各种癌症患者和健康人体中分布的情况,并评估基于TEPs的测序能否作为癌症分级和癌症辅助诊断的方法。
Myron G的研究团队,从283名对象身上抽血,分离血小板,提取血小板RNA,扩增RNA随后进行测序。结果显示:基于TEPs的RNA测序能够区分出228名是肿瘤患者(包括局部和转移肿瘤)和55名是健康个体,其准确率达96%。也可以区分6种不同类型的肿瘤,其准确率达到了71%。基于TEPs的RNA测序,使her2阳性,KRAS基因突变,表皮生长因子受体或PIK3CA阳性的肿瘤得以准确区分。结果表明,肿瘤血小板mRNA为泛癌症检测、肿瘤分类和肿瘤突变基因诊断提供了一个有价值的平台,并促进了基于血液的液体活检的发展。
随着肿瘤分子生物学研究的进展,基于血小板的RNA测序及其生物学指标的研究,将有可能为临床肿瘤的早期诊断、预后判定及跟踪随访等提供一系列方便、快捷、特异、无创或微创的分子生物学检测手段。
原始出处:
Myron G. Best, et al. RNA-Seq of Tumor-Educated Platelets Enables Blood-Based Pan-Cancer, Multiclass, and Molecular Pathway Cancer Diagnostics.Cancer Cell (2015),http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2015.09.018
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这篇资讯带给我们新知识,启发新思维,不论是科研还是临床工作都有很大的帮助。。。
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