单细胞测序应用及技术实例
作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比,单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确,而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA,其优势是全方位和多层次的。与此同时,测序巨头相继推出新一代测序仪,为单细胞测序提供利器,越来越多与单细胞测序有关的研究也发表在顶级期刊上,这些都表明,单细胞测序已逐渐成为科研热点。单细胞测序应用及技术实例单
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2017-03-07
单细胞测序技术“遍地开花” 精准医疗“如虎添翼”
基因测序在体外诊断市场中的重要性日益突出。其中,单细胞测序技术自2009年问世,2013年被Nature Methods评为年度技术以来,越来越多地被应用在科研领域。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现,彻底降低了单细胞测序的成本门槛。自此,单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。
转化医学网 - 单细胞测序技术,精准医疗 - 2019-06-25
新型单细胞测序技术成功助力!
黑色素瘤是皮肤肿瘤中恶性程度最高的一种肿瘤,其扩散速度快,并且更偏爱男性。据《A Cancer Journal for Clinicians》2017年发表的癌症统计,黑色素瘤发病率在男性中比在女性中高约60%,死亡率在男性中比在女性中高出一倍以上。最糟糕的是黑色素瘤对放疗不敏感,所以晚期黑色素瘤患者从常规疗法中获益极少。但是免疫疗法打破了这一僵局。
转化医学网 - 癌症疫苗,单细胞测序,黑色素瘤 - 2019-01-28
ATAC-seq技术再升级:单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术
基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能,可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段(通常80-300 bp),这些短片段被当作开放染色质的信号。
iNature - ATAC-seq技术再升级,单分子测序,单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13
Nature:RNA单细胞测序技术意外找到了慢性鼻炎的根源
MIT、Brigham和妇女医院的研究人员对来自人类患者的数千个单细胞进行了全基因组分析,创建了炎症期间人类屏障组织的第一张整体细胞图谱,通过对这些数据分析,他们找到了一个可以解释慢性鼻窦炎病因的新机制
生物通 - RNA,测序,慢性鼻炎,鼻息肉 - 2018-08-24
Science:单细胞测序细分肿瘤亚型
美国麻省总院和Broad研究所合作发表在3月31日Science杂志上对两种脑肿瘤亚型的详细分析显示,它们起源于神经祖细胞的相同类型,由基因突变模式和其微环境的组成分而区分开。
生物探索 - 肿瘤,单细胞测序 - 2017-04-04
Cell:新型单细胞测序技术帮助分析乳腺癌的肿瘤侵袭模式
由于乳腺导管中的癌细胞数目很少和不同肿瘤克隆之间的异质性,研究人员很难对肿瘤细胞的基因组进化过程进行了解。
学术经纬 - DCIS,IDC,单细胞测序技术 - 2018-01-15
单细胞研究指南:测序方法大比拼
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这些问题曾经是单细胞
Ebiotrade - 单细胞,测序方法 - 2016-05-18
Nature:如何利用单细胞mRNA测序发现罕见细胞类型?
近日,来自荷兰的科学家在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展,他们利用一种新的计算方法结合转录组测序发现了小肠中一些罕见的细胞类型,这对于深入了解器官的细胞组成,探究健康和疾病状态下的组织生物学具有重要意义理解一个器官的发育和功能需要对组成该器官的所有细胞类型的特性有一个清晰的认识。传统发现认为分离细胞亚群的方法是基于几个已知的标记基因表达出来的信使RNA或蛋白质实现
生物谷 - 单细胞mRNA,罕见细胞类型,Reg4,Lgr5 - 2015-08-25
Cell:单细胞全基因组高精彩度测序技术
日前,《细胞》(Cell)杂志上分别报道了来自中国学者的两项最新研究成果。复旦大学的徐彦辉等人首次破解 TET2 -DNA复合物的晶体结构;而来自北京大学的乔杰、汤富酬和谢晓亮等人则发布了突破性单细胞基因组检测技术。
生物360 - Cell,单细胞,全基因组,测序 - 2013-12-25
单细胞测序的方法和应用
单细胞测序的应用过去二十几年里,随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展,基因组研究日渐被 推向高潮。然而,迄今为止使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合DNA样本。这种方法能够得到全基因组序列信息,但是对其进行研究得到的结 果只是一群细胞中信号的平均值,或者只代表其中占优势数量的细胞信息,单个细胞独有的特性
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2014-04-06
单细胞RNA测序--TargetAmp法、SMART法
TargetAmp法测单细胞全RNA Illumina旗下的EpiCentre公司开发的TargetAmp方法,可以把少量RNA(最少到1个细胞,约10pg)扩增到ng级,以达到可以进行高通量测序所需的核酸量
陈巍学基因 - 单细胞测序,SMART - 2014-04-06
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