Med：新冠病毒可能藏匿于肠道，可长达210天

COVID-19 是一种具有多变表现的疾病，从呼吸道到胃肠道再到全身。 尽管 SARS-CoV-2 感染的主要部位是呼吸道，但存在影响其他器官系统的症状（例如，腹痛、恶心、关节痛），再加上 SARS-CoV-2 在多种病毒中具有传染性的体外证据 其他组织，表明 SARS-CoV-2 感染可以延伸到呼吸系统之外。 对 COVID-19 住院患者的研究的荟萃分析估计，恶心、呕吐和腹泻等胃肠道 (GI) 症状的合并发生率在 11% 至 18% 之间。

有趣的是，在少数调查纵向粪便样本的研究中，即使在呼吸道排出停止后，SARS-CoV-2 RNA 的粪便排出时间也会延长。 事实上，在一个值得注意的儿科病例中，粪便病毒 RNA 脱落在疾病发作后超过 70 天。8 如果粪便中脱落的 SARS-CoV-2 RNA 表明存在胃肠道感染，这表明 SARS-CoV-2 感染了 从呼吸道清除后，胃肠道可以继续。

SARS-CoV-2 在胃肠道中的存在与患者健康具有额外的相关性。 胃肠道是一种高度免疫活性的组织，该身体部位的 SARS-CoV-2 抗原可能会针对 SARS-CoV-2 病毒的变体产生体液免疫反应。

在这里，我们试图更好地定义 SARS-CoV-2 在胃肠道中存在的特征及其与短期和长期人类健康的相关性。 我们利用 Peg-干扰素 lambda-1a (IFN-λ) 与安慰剂对照的随机对照研究的个体的纵向粪便和呼吸道样本来治疗轻度至中度 COVID-19 (n = 120)。35 而 干预并未缩短 SARS-CoV-2 RNA 口咽脱落（主要结果）或疾病症状（次要结果）的持续时间，该研究提供了丰富的前瞻性收集的数据集，用于评估粪便脱落动态及其与胃肠道症状的关系。最近斯坦福大学医学院、医学（血液学）和遗传学副教授Ami S. Bhatt开展了一项相关研究，这些研究结果发表在Cell子刊Med上。

Peg-IFN-λ 临床试验 (NCT04331899) 在 2020 年 4 月 25 日至 7 月 17 日期间招募了 120 名患有轻度至中度 COVID-19 的参与者。35 其中，113 名参与者在六个预定的粪便收集时间点之一收集了至少一份粪便样本。 这些收集时间点集中在第 3 天（范围 = 0-7 天）、14 (8-21)、28 (22-35)、120 (75-165)、210 (166-255) 和 300 (>255 天）注册后（图 1A）。 在这 113 名参与者中，86 名提供了至少三个时间点的样本。

图：随时间变化的粪便和口咽病毒 gRNA 测量

图：IFN-λ对粪便病毒RNA脱落的影响

不过，作者也认为，尽管 gRNA 经常被用作 SARS-CoV-2 感染的指标，但这种生物分子并不标志着活跃的感染，因为非感染性病毒颗粒也可能含有 gRNA。亚基因组 RNA (sgRNA) 是积极复制病毒的一个可能指标，尽管关于其特异性的争论仍在继续。因此，我们如前所述量化了 sgRNA；39 23.8%（95%CI = 15.2%–35.3%）的参与者在诊断后的第一个时间点检测到 sgRNA（每 μL 洗脱液中病毒 sgRNA 的 0.8–5.69 log10 拷贝） 。相比之下，49.2% (38.2%–60.3%) 的参与者在诊断后的第一个时间点检测到 gRNA。虽然有些样本的 gRNA 检测呈阳性但 sgRNA 检测不呈阳性，但没有检测到 sgRNA 但未检测到 gRNA 的样本。最后，在第四个时间点，SARS-CoV-2 sgRNA 几乎完全清除，0.7% (0.2-3.0%) 的样本保持 sgRNA 阳性。

在最近的有限研究中，粪便 SARS-CoV-2 RNA 的存在与胃肠道症状的存在有关。然而，这些研究在本质上大多是横断面的，回顾性地收集症状学数据，并且没有使用统一的基准方法来量化粪便中的 SARS-CoV-2 RNA。为了解决粪便病毒 RNA 脱落是否与胃肠道症状相关的问题，我们收集了全面的纵向症状学数据，包括本干预试验中研究参与者的胃肠道症状信息，并将这些数据与他们粪便中测量的绝对病毒 RNA 浓度进行了比较（图 4A） ）。在研究的第一个月，我们发现在粪便中排出病毒 RNA 的参与者更有可能报告恶心（aOR = 1.61，95% 置信区间 = 1.09-2.39）、呕吐（3.20、1.11-9.21）和腹痛 (2.05, 1.09–3.86);没有观察到病毒 RNA 脱落与腹泻（1.10, 0.63–1.91）或考虑任何胃肠道症状（1.38, 0.94–2.04）之间的关联。包括流鼻涕 (1.67, 1.05–2.66)、头痛 (1.56, 1.04–2.35) 和身体疼痛 (2.21, 1.45–3.38) 在内的呼吸道和全身症状也与粪便 SARS-CoV-2 RNA 的存在有关。综合这些结果，粪便 SARS-CoV-2 RNA 脱落与大多数胃肠道症状以及特定的全身和呼吸道症状呈正相关。

图：粪便病毒 RNA 脱落与症状之间的关联

这项研究表明 SARS-CoV-2 在呼吸道组织中的清除速度比在胃肠道组织中更快，并且胃肠道可能是长期感染的部位。这项研究已经证明了任何 COVID-19 患者粪便 SARS-CoV-2 RNA 的最长记录脱落时间：两名患者感染后约 210 天。此外，我们发现，在 OP 拭子中不再可检测到病毒 RNA 的参与者中，SARS-CoV-2 RNA 的延长脱落与许多全身和胃肠道症状密切相关，这为 SARS-CoV-2 感染提供了进一步的证据的肠道。此处提供的数据在初步工作的背景下表明，在 COVID-19 参与者的肠道活检中延长存在 SARS-CoV-2 病毒抗原可能与改善的免疫反应有关，21 敦促跟进调查粪便样本的免疫学研究。最后，旨在阐明 PASC 迄今难以捉摸的现象的研究 COVID 以增强恢复 (RECOVER, NIH) 等举措应密切关注粪便样本，将其视为具有潜在长期影响的 SARS-CoV-2 感染的重要因素。

但是，作者也指出，由于研究手段的局限性，没有办法在粪便中进行病毒 RNA 进行测序，因此，也不知道病毒是何种变体。但是研究还是原始变体为主。另外，当前的Omicron已发生很大变化，会不会贮留于粪便中，还不清楚。

不过，这项发现为越来越多的证据提供了支持这一假设，即持续存在的病毒碎片——Bhatt称其为“幽灵”——可能导致一种被称为long COVID神秘疾病。

当然，这项研究还有很多潜在的不足，肠道中的病毒是否具有传染性？另外，肠道中长时间贮留的病毒是否具有活性？Omicron作为嗜鼻的病毒，会不会也贮留肠道，这些都是新的疑问。

但是，如果肠道中病毒长时间存活，并具有感染力的话，那样对任何防控措施都是极大的挑战，甚至成为不可能。

原始出处：

Natarajan A, Zlitni S, Brooks EF, Vance SE, Dahlen A, Hedlin H, Park RM, Han A, Schmidtke DT, Verma R, Jacobson KB, Parsonnet J, Bonilla HF, Singh U, Pinsky BA, Andrews JR, Jagannathan P, Bhatt AS. Gastrointestinal symptoms and fecal shedding of SARS-CoV-2 RNA suggest prolonged gastrointestinal infection.Med (N Y). 2022 Apr 13. doi: 10.1016/j.medj.2022.04.001.