WJP:基于二代测序的新生儿单基因遗传病筛查
2023-07-07 小文子 MedSci原创 发表于上海
研究证明NBGS是一种有效策略,可以识别患有可治疗疾病的新生儿,作为当前NBS方法的补充。
新生儿疾病筛查(NBS)是一项重要而成功的公共卫生计划,通过提供某些先天性疾病的早期诊断和治疗,有助于改善新生儿的长期临床结局。二代测序(NGS)技术的发展为扩大当前新生儿筛查方法提供了新的机会。World Journal of Pediatrics杂志发表了一项研究,对75种新生儿先天性疾病和135个基因进行分析,探讨这些新生儿先天性疾病在中国不同地区的发病率和携带者频率。
2020年11月-2021年11月,共随机采集了21442份新生儿样本。样本从6个地区的12家医院采集,参与研究的新生儿纳入标准如下:
(1)新生儿已经或将要接受串联质谱法;
(2)中国独生子女;
(3)父母健康状况良好,无严重的急慢性病史和明确的遗传病
(4)随访至项目结束。
研究介绍了不同地区疾病和相关变异的阳性检测率和携带者频率;
当检测到X连锁基因中的半合子变异或常染色体隐性基因的双等位基因变异时,该受试者被视为阳性病例。在整个队列中,阳性病例最多的前6个基因是葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)(50.37/10000)、苯丙氨酸羟化酶(PAH)(9.79/10000)、缝隙连接蛋白β2(GJB2)(3.26/10000)、双氧化酶2(DUOX2)(2.80/10000)、溶质载体家族22成员5抗体(SLC22A5)(2.33/10000),和溶质载体家族26成员4(SLC26A4)(1.40/10000)。不同地区有显著差异。G6PD变异的阳性检测在华南地区很常见,而PAH变异在华北地区最常见。
此外,NBGS鉴定出3例DUOX2变异和1例SLC25A13变异,这些病例在常规NBS中是正常的,但在召回后的重复生化检测中被确认为异常。80%的高频基因携带者和60%的高频变异携带者存在明显的区域差异。在出生体重和胎龄无显著差异的前提下,SLC22A5 c.1400C>G和ACADSB c.1165A>G携带者的生化指标与非携带者有显著差异。
研究证明NBGS是一种有效策略,可以识别患有可治疗疾病的新生儿,作为当前NBS方法的补充。数据还表明,疾病的流行具有显著的区域特征,这为不同地区的疾病筛查提供了理论依据。
原文出处:
Ru‑Lai Yang, Gu‑Ling Qian, et al, A multicenter prospective study of next‑generation sequencing‑based newborn screening for monogenic genetic diseases in China, World Journal of Pediatrics, 2023, https://doi.org/10.1007/s12519-022-00670-x.
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