NATURE：儿童早期肠道微生物的发育情况如何？
2018-10-26 MedSci MedSci原创
微生物组从婴儿期到儿童期的发展依赖于一系列的因素，在这期间，微生物的免疫交谈被认为与后来生命疾病的病理生物学有关。如持续性胰岛自身免疫和1型糖尿病。然而目前，对于婴儿期到儿童期这一阶段的肠道菌群的发展变化仍不是很清楚。 在本研究中，研究收集了来自美国（科罗拉多、乔治亚和华盛顿州）和欧洲（德国、瑞典和芬兰）6大临床中心的婴儿粪便样本，利用16S rRNA基因测序分析了来自903名儿童的1250
微生物组从婴儿期到儿童期的发展依赖于一系列的因素，在这期间，微生物的免疫交谈被认为与后来生命疾病的病理生物学有关。如持续性胰岛自身免疫和1型糖尿病。然而目前，对于婴儿期到儿童期这一阶段的肠道菌群的发展变化仍不是很清楚。
在本研究中，研究收集了来自美国（科罗拉多、乔治亚和华盛顿州）和欧洲（德国、瑞典和芬兰）6大临床中心的婴儿粪便样本，利用16S rRNA基因测序分析了来自903名儿童的12500个粪便样本以及10867份宏基因组样本。
研究结果表明，婴儿肠道菌群的组成及多样性变化可分为三个不同阶段：发育期（3-14个月）、过渡期（15-30个月）和稳定期（31-46个月）。无论是部分还是全部母乳喂养，均表明该因素是婴儿肠道菌群结构组成的最重要因素。母乳喂养与双歧杆菌（Bifidobacterium，包括B. breve和B. bifidum）含量升高有关。母乳的停止导致肠道菌群的快速成熟，如厚壁菌门。此外，出生模式也与发育阶段的微生物组显著相关，这是由阴道分娩的婴儿中较高水平的拟杆菌(尤其是脆弱杆菌)所驱动的。无论出生方式如何，拟杆菌也与肠道多样性的增加和更快的成熟有关。环境因素包括地理位置和家庭接触(如兄弟姐妹和毛茸宠物)也代表了重要的协变量。
本研究确定了早期微生物组的结构和功能，并为靶向机理研究微生物免疫交谈对长期健康的影响提供了基础。
原始出处：
Christopher J. Stewart, Temporal development
of the gut microbiome in early childhood from the TEDDY study
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