教训,研究需更精细!Nature撤回一项关于三阴乳腺癌的研究
2015-04-16 Zhang JL译 MedSci原创
威尔康奈尔医学院研究人员试图验证之前所报道的三阴乳腺癌的分子,并希望以此作为靶向治疗这一侵袭性肿瘤的靶点。然而,他们发现该结果仅限于一个病人,不能应用于进一步的临床工作。这一发现发表在4月<span lang="EN-US" style="mso-bidi-font-size: 10.5pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"
威尔康奈尔医学院研究人员试图验证之前所报道的三阴乳腺癌的分子,并希望以此作为治疗这一侵袭性肿瘤的靶点。然而,他们发现该结果仅仅限于一个病人,不能应用于进一步的临床工作中。这一发现发表在4月15日的Nature 杂志上,这项发现弥补了前一个研究的不足,强调了独立研究验证和仔细分析发展的重要性。
事件回顾:
2012年6月,麻省理工和哈佛大学的研究人员在Nature 杂志上发表了一篇研究,报道了一个从少量但有意义的三阴性乳腺癌患者肿瘤样本中发现一个特别致命的亚型,这个亚型目前鲜有有效的治疗方案。该研究小组得出的结论是,MAGI3-AKT3融合基因可以为药物开发提供新的分子靶点。
这个研究发表后不久,Mark A. Rubin 博士、Sandra J. Shin 和 Juan Miguel Mosquera 领导的研究小组对该基因融合在威尔康奈尔的三阴性乳腺癌样本集中的发生频率进行了验证。
该文章的第二作者、威尔康奈尔和纽约长老会医院精密医学研究所主任Rubin博士说:“大型基因组研究报告了大量新的突变数据,但是其中一些仍缺乏验证。”
他们为此开发了一个组织分析测试方法,可以显示出 MAGI3-AKT3 融合阳性的样本,这种方法通常用于研发生物标志物,是威尔康奈尔团队特长领域。然而,令所有人惊讶的是,他们并没有在威尔康奈尔样本中检测出这种突变阳性。
“由备受尊重的研究者发表在顶级杂志上,MAGI3-AKT3 融合基因的发现为三阴乳腺癌开发新的靶向治疗提供了巨大的希望和兴奋。” 威尔康奈尔医学院乳腺癌病理和病理学和实验室医学副教授 Shin 博士说。
“但我们必须澄清,我们仅仅仅在最初报道那一个案例中发现了那种突变现象,除此之外并没有再次发现,” 威尔康奈尔医学院和病理精密医学研究所的领导人、病理学和实验室医学助理教授 Mosquera 博士说,“在这种情况下必须由病理学来验证,因此最初的发现需要修改和承认,这个我们工作一直强调之处。”
漫长研究,只为验证
为了完全否定 MAGI3-AKT3 融合基因的发现,威尔康奈尔团队从筛查150多内部样本开始,这无疑是一个漫长的过程。他们理应如原本发表在 Nature 上的研究所说,发现约 7% 的样本包含融合基因,但事实却没有一项是符合的。同时,他们也注意到当年( 2012年)所研究的原始肿瘤,从未在基因组层面证实这个变更。相反,最初的研究小组是使用了一个 RNA 筛选试验并基于这些发现假设了其他的肿瘤也有突变。
威尔康奈尔团队进一步测试超过100 例从癌症基因组图谱和苏黎世大学医院获取的样品。遗憾的是,他们也无法在这些情况下证实最初的发现。
大约两年前,他们把自己的发现告知 Nature 杂志和 Broad 研究所的研究人员,让这些研究人员分析他们的 72 个患者样本,再加上额外的 370 个乳腺肿瘤样本。当他们在 DNA 水平上重新测试样品时,他们只在第一种情况下发现基因融合,导致这成为一个孤立的发现而不能用于开发未来的临床试验。
威尔康奈尔团队同意 MAGI3-AKT3 融合基因的发现应该在基因组水平验证后才把结果公布。
“我们的研究表明生物标志物开发的重要过程以及精密医学的一个重要性。” Rubin 博士说。
“我们很高兴地知道,我们的结果已经节省了许多研究时间、精力和资源,因为这些都是最终朝着一个不可能完成的目标” Shin 博士说,“同样重要的是,病人免于参加临床试验,因为这不可能有了一个积极的结果。”
原始出处:
Juan-Miguel Mosquera, Sonal Varma, Chantal Pauli, Theresa Y. MacDonald, Jossie J. Yashinskie, Zsuzsanna Varga, Andrea Sboner, Holger Moch, Mark A. Rubin, Sandra J. Shin. MAGI3–AKT3 fusion in breast cancer amended.Nature, 2015; 520 (7547): E11 DOI: 10.1038/nature14265
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