Nature论述:单细胞基因组学揭开“免疫新世界”
一个多世纪以来,科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞,从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程,挖掘重要的细胞类型和信号通路。
生物探索 - 单细胞基因组学,免疫 - 2017-07-10
Genome Biol综述 | 多模态和单细胞/亚细胞水平空间组学技术的现状及发展前景
空间组学领域在过去几年蓬勃发展,并从根本上提高了原位实验的广度和分辨率。这些技术现在可以在50-100nm的空间分辨率下检测超过10,000个独特的基因靶点。
测序中国 - 多模态和单细胞,亚细胞水平空间组学技术,空间组学实验 - 2022-12-29
Circulation:单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征
内皮细胞(EC)根据其所处的血管和组织表现出相当大的功能异质性。虽然这些功能上的差异可能被记录在转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
MedSci原创 - 内皮细胞,转录组,单细胞RNA测序 - 2020-09-19
Nat Neurosci: fMOST助力构建全球单细胞投射组学数据库
单细胞投射组学结果表明这些投射神经元具有64个亚型(IT具有44个亚型,PT具有12个亚型,CT具有8个亚型)。
“神经周K”公众号 - fMOST,单细胞投射 - 2022-09-14
Nat Commun:空间转录组学和单细胞多组学整合分析构建人类胸腺细胞发育空间图谱
研究团队开发了TSO-his(组织结构的转录组学分割)工具,用于整合单细胞和空间转录组学的多模态数据,并破译人类胸腺的复杂结构。
测序中国 - 胸腺,空间转录组学,空间图谱 - 2024-10-14
单细胞测序应用及技术实例
作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比,单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确,而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA,其优势是全方位和多层次的。与此同时,测序巨头相继推出新一代测序仪,为单细胞测序提供利器,越来越多与单细胞测序有关的研究也发表在顶级期刊上,这些都表明,单细胞测序已逐渐成为科研热点。单细胞测序应用及技术实例单
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2017-03-07
A&R:尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学提示白细胞介素16在狼疮肾炎中的作用
与没有系统性红斑狼疮的对照组相比,该研究确定了237个与狼疮性肾炎相关的尿液生物标志物。白细胞介素16 (IL-16)、CD163和转化生长因子β反映了肾内肾炎的活性。
MedSci原创 - 肾脏,蛋白质组学,狼疮肾炎,尿液,资讯,单细胞组学,白细胞介素16 - 2022-05-19
科学家使用单细胞组学技术揭示了指导前额叶皮层发育和成熟的关键基因调控网络
科学家使用单细胞组学技术揭示了指导前额叶皮层发育和成熟的关键基因调控网络。
神经科学临床和基础 - 单细胞组学技术,前额叶皮层发育,成熟的关键基因 - 2022-11-15
Protein & Cell:王永成/樊龙江团队合作开发微生物组单细胞转录组测序技术
该研究建立了基于随机引物的高通量单细胞RNA测序技术及其数据分析方法,首次实现了复杂微生物组样本的高通量单细胞转录组测序与分析。
测序中国 - 微生物组,单细胞转录组测序 - 2024-06-01
Circulation:血浆蛋白质组学联合单细胞转录组学“排序”心梗后心衰标志物
心力衰竭(HF)是急性心肌梗死(MI)的最常见的远期并发症。了解与MI后HF相关的血浆蛋白及其基因表达可能会为发现生物标志物和药物靶标确定新的候选对象。
MedSci原创 - 心肌梗死,心力衰竭,蛋白质组学,生物标志物,单细胞转录组学 - 2020-10-15
Science Translational Medicine:单细胞转录组学鉴定体内HIV-1的原胸腺酶α限制
本文研究结果确定原胸腺酶α是体内限制HIV-1感染的宿主因子,这对病毒传播和治疗策略具有重要意义。
MedSci原创 - HIV-1,单细胞转录组学 - 2023-08-30
2018单细胞组学技术与应用研讨会
近年来,单细胞组学领域发展得非常迅速,为人们研究肿瘤异质性以及微生物群落的生态多样性提供了新的视角。我国科学家也先后在顶级期刊发表诸多单细胞组学研究成果, 如北大谢晓亮团队开发的单细胞基因组线性扩增的方法—LIANTI,MALBAC® (Multiple Annealing and Looping BasedAmplification Cycles)技术、汤富酬团队开发的
MedSci原创 - 单细胞 - 2018-09-14
Cell:单细胞全基因组高精彩度测序技术
日前,《细胞》(Cell)杂志上分别报道了来自中国学者的两项最新研究成果。复旦大学的徐彦辉等人首次破解 TET2 -DNA复合物的晶体结构;而来自北京大学的乔杰、汤富酬和谢晓亮等人则发布了突破性单细胞基因组检测技术。
生物360 - Cell,单细胞,全基因组,测序 - 2013-12-25
单细胞转录组研究进展
单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战
生物化学与生物物理学进展 - 转录组,单细胞转录组 - 2014-01-03
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