BJC:CpG岛甲基化表型与CRC预后无关
之前的研究已经表明,CpG岛甲基化表型(CIMP)对结直肠癌(CRC)的预后有不利影响。。然而,样本往往是有限的,只有少数的研究能够调整相关分子特征与分布。
MedSci原创 - CpG岛甲基化,表型,CRC,预后 - 2016-11-12
Genome Biol:ONT、PacBio长读长测序CpG甲基化检测工具的系统比较
首次对长读长测序的CpG甲基化检测工具进行了系统比较,包括最新的ONT R10.4流动槽化学测序、氧化亚硫酸盐测序(oxBS)以及SMRT测序。
测序中国 - 甲基化,CpG,长读长测序 - 2024-04-17
A&R:纵向队列中与SLE亚型相关的CpG位点甲基化动态变化
在这个SLE纵向队列中确定了SLE亚型相关CpG的一个子集,它们随着时间的推移是稳定的,并且可能可用作疾病亚型的生物标志物。与全基因组甲基化组相比,另一个与SLE亚型相关的CpG子集的变化比例更高。
MedSci原创 - 系统性红斑狼疮,生物标志物,DNA甲基化,CpGs,纵向队列 - 2022-06-06
Clin Chem:甲基化CpG串联扩增测序法可用于检测大肠癌循环游离DNA
在人类结直肠癌(CRC)基因组中,CpG岛的异常DNA高甲基化最为常见。因此,利用循环游离DNA (cfDNA)进行全基因组DNA高甲基化分析技术,对CRC的早期无创检测和CRC与其他癌症类型的鉴别具有重要的应用价值。采用甲基化CpG串联扩增测序(MCTA-Seq)方法,采用完全甲基化分子算法,对CRC患者(n = 147)和对照组(n = 136)的血浆样本,以及癌症和癌旁非癌组织样本(
MedSci原创 - 癌循环游离DNA,甲基化 - 2019-07-20
Nat Commun | 仅4个CpG甲基化位点即可识别肝癌患者,特异性100%,灵敏度98%
研究论证了高通量DNA甲基化测序方法的可行性,这种方法可以用少量血液对少量的CpG位点进行检测,以便对HCC患者进行分类。
测序中国 - 肝癌,CpG甲基化位点 - 2023-07-07
IBD:TGFβ1和IL-6基因中的 CpG甲基化是诊断儿童IBD的生物标志物
本项研究了旨在评估转化生长因子β1(TGFβ1)和白介素6基因启动子的甲基化标记是否具有诊断作用。
MedSci原创 - IBD,甲基化 - 2020-05-16
Nature Genetics:林东昕/郑健团队等首次揭示RNA甲基化可调控DNA甲基化
DNA甲基化修饰改变引起的基因表达改变在肿瘤的发生发展中起重要作用。例如,癌细胞基因组常常有癌基因的低甲基化和抑癌基因的高甲基化改变,但DNA甲基化改变的机制目前并不完全清楚。
“生物世界”公众号 - DNA甲基化,RNA甲基化 - 2022-10-20
PNAS:谢晓亮课题组开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术
该研究利用该技术描绘了小鼠早期胚胎发育过程中甲基化、羟甲基化以及半甲基化修饰的动态变化,揭示了小鼠早期胚胎甲基化重编程过程中主动/被动去甲基化的活力变化以及参与父母本基因表达调控机制的差异。
测序中国 - DNA甲基化,单细胞甲基化,羟甲基化测序技术 - 2023-12-19
PNAS:北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术
该研究提出了一种无亚硫酸氢盐的单细胞全基因组5mC和5hmC分析技术,命名为Cabernet,它可以在高基因组覆盖率下以单碱基分辨率表征5mC和5hmC。
iNature - 测序,单细胞甲基化,羟甲基化 - 2023-12-28
Nature:体重指数与DNA甲基化相关!
虽然目前对肥胖及其相关临床条件的机制了解甚少,但是最近的研究表明肥胖可能会影响DNA甲基化,DNA甲基化是基因表达和分子表型的关键调节器。近期,一项发表在Nature杂志上的文章使用了表观基因组证实:身体质量指数(BMI)与DNA甲基化的广泛
MedSci原创 - 体重指数,肥胖,DNA - 2016-12-25
Blood:新型去甲基化药物OR-2100靶向治疗DNA异常超甲基化驱动的ATL白血病
成人T细胞白血病-淋巴瘤(ATL)是一种由人T细胞淋巴病毒-1(HTLV-1)转化的侵袭性的CD4+T细胞血液恶性肿瘤。大部分HTLV-1感染的个体无症状,仅3-5%的HTLV-1携带者会发展成ATL
MedSci原创 - 地西他滨,超甲基化,ATL白血病 - 2020-06-06
IBD:TGFβ1和IL-6基因中的 CpG甲基化是区分儿童CD与UC的良好生物标志物
克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)都是慢性复发性炎症性肠病(IBD),儿童发病的患者也非常多。患有CD或UC的儿童通常会经历很多挑战。
MedSci原创 - 甲基化,CD - 2020-10-02
Nature:体重超重影响DNA甲基化
在假期你增加的额外体重将不仅出现在你的臀部,而且也会影响你的DNA。这是德国亥姆霍兹慕尼黑中心合作的一项大规模国际研究的结果。它表明较高的身体质量指数(BMI)会导致人基因组中将近200个位点发生表观遗传变化,从而影响基因表达。相关研究结果于2016年12月21日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Epigenome-wide association study of body mass i
生物谷 - 超重,DNA甲基化 - 2016-12-26
Nat Neurosci:Rett综合征可能与MeCP2突变导致非CpG甲基化有关
在正常的发育过程中,所有的细胞往往会通过一种叫做甲基化的过程,将一种化学甲基添加到DNA上,来关闭它们不需要的基因。以往科学家们认为甲基只能附着到CpG位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点。但是近年来,研究人员发现甲基也存在于其他的序列上,在干细胞和大脑神经元中也发现有所谓的非CpG甲基化作用。
MedSci原创 - Rett,MeCP2,CpG,甲基化 - 2014-02-07
DNA甲基化检测技术应用与技术比较
DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要范畴,已经越来越受到研究者的关注。近些年来,随着DNA甲基化与组蛋白甲基化的联合作用机制、RNA干扰机制及去 甲基化机制的发现,使得DNA甲基化研究受到广泛关注,从医学领域扩展到动植物研究当中,同时在研究方法上也取得了很大的突破。现在用于DNA甲基化检测 的方法大概有十多种,从应用上来分,大致可以分成两类:全基因组甲基化分析及特异位点甲基化检测。下面,我
MedSci原创 - DNA甲基化,检测 - 2014-02-05
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