中科院:与美国同步共享5株2019新型冠状病毒基因组序列
中国科学院7日在官网上发文披露,国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)首批自主收录的5株2019新型冠状病毒基因组序列实现与美国NCBI核酸数据库GenBank数据同步与共享。全文如下:国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)首批自主收录的5株2019新型冠状病毒基因组序列实现与美国NCBI核酸数据库GenBank数据同步与共享。CNCB/NGDC
健康界 - 新型冠状病毒 - 2020-02-13
Genome Bio:灵敏、快速的基因组污染检测新工具FCS-GX,可自动去除污染序列、提高数据质量
究团队开发了FCS-GX,其是NCBI外来污染筛查工具套件的一部分,经过优化,可识别和去除新基因组中的污染物序列。
测序中国 - FCS-GX,基因组污染 - 2024-03-25
2019新型冠状病毒资源库发布
2020年1月22日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不同冠状病毒株的基因组序列做了变异分析与展示。
中科院之声 - 肺炎,新型冠状病毒 - 2020-01-23
一例裴氏着色霉引起的着色芽生菌病及病原真菌研究
患者男性,34岁,左膝周围红色斑块12年。12年前在广东省某砖厂劳动时被砖块刺伤左膝部,此后刺伤处渐出现红斑块,上覆黄白色痂壳,伴有瘙痒。曾在外院被诊断为银屑病或皮肤结核,但所有的内服及外用药物均无效。患者其他方面健康。查体左膝部皮肤见红色斑块(约20 cm×17 cm),覆盖黄白色痂壳,可见黑点和红点,未见糜烂渗出(图1a,b)。初诊取皮损处鳞屑标本加氢氧化钾直接镜检即发现硬壳细胞(图1c)。取
CSDCMA资讯平台 - 裴氏着色霉,着色芽生菌病,病原真菌研究 - 2019-09-04
疫情爆发后,至少已有77篇新冠病毒英文论文发表!
近日,Nature团队使用“coronavirus”、“ ncov”等关键词检索新型冠状病毒相关的研究,截止当地时间2月4日,至少已有77篇新型冠状病毒相关的英文研究文章发表。检索来源包括:预印本平台bioRxiv (https://www.biorxiv.org)、medRxiv (https://www.medrxiv.org/) 和ChemRxiv (https://chemrxiv.org
医咖会 - 新冠病毒 - 2020-02-07
紫色毛癣菌致老年人黑点癣1例
患者女, 76 岁。6 个月前出现头皮瘙痒,脱发, 于外院诊断为“毛囊炎,头癣”,予伊曲康唑 100 mg/次, 2 次/d,维胺酯 50mg/次治疗。5 个月前患 者自行停药后使用中药及外搽复方酮康唑软膏, 2 次/d 治疗。
中国皮肤性病学杂志 - 紫色,毛癣菌,老年人,黑点癣 - 2018-11-29
江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒
该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段,后根据高通量测序reads序列设计特异引物,对病人咽拭子样本进行PCR扩增,产物经过sanger测序、序列组装,于10月26日获得该病毒全长基因序列3018 nt。该病毒基因组含2种主要
江苏疾控 - 2016-12-16
全球闻所未闻!江西省儿童医院发现B型血型新成员
今年2月15日,该医院输血科所提交的该变异基因特异性核酸序列在该中心的"GenBank数据库"进行了公布,核酸序列号为kx365163。据悉,该医院输血科在为该患儿备血进行输血前
欧阳兴 肖依 - 江西,血型,首例 - 2017-08-27
【在线课堂】预告:分子生物信息数据库
分子生物信息数据库种类繁多。归纳起来,大体可以分为4个大类,即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构序列数据库、生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库、以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。来自MedSci学院的 张博士 为大家带来看关于分子生物信息数据库的课程讲解。一共4节课:课程表:分子生物信息数据库1: 基因组和分子生物信息数据库的介绍(链接)分子生物信息数据库2: 核酸序列数
MedSci原创 - 分子生物信息,数据库,在线课堂 - 2015-07-09
新型冠状病毒是科学家人为泄露出来的?这你也信?
撰文| 王立铭 浙江大学生命科学研究院教授、研究员、博士生导师新型冠状病毒和2018年武汉病毒所科学家发现的病毒毫无关系。遇到阴谋论,先给自己点冷静的时间讨论一个很简单也很惊悚的问题:这次的新型冠状病毒(2019-nCoV)是不是人为泄露出来的?这个问题可不是我瞎编出来的,最近两天来找我求证的人只怕得有上百,其中不少还是各自领域的大专家和大领导。大家的“根据”,主要就是下面这个旧闻:2018年
新浪 - 新型冠状病毒,武器 - 2020-01-29
我国发现世界首例缺失型α地中海贫血突变基因
经过近2年的研究,该院检验科主管技师李友琼等医务人员发现了世界首例缺失型α地中海贫血突变基因,并于日前在美国DNA数据库成功注册。这一新突变基因的发现,不仅丰富了世界地中海贫血突变基因数据库,同时为在临床上避免地贫患儿的降生及科学研究提供了新的参考信息。 据介绍,该例缺失型α地中海贫血突变基因由李友琼等医务人员于2011年首次发现,携带者是当时到该院做产前检查的一名孕
新华社 - 缺失型α地中海贫血,GenBank - 2013-11-08
北京宣武医院鉴定两例国内首次发现菌种
近日,首都医科大学宣武医院检验科细菌室应用分子生物学技术和质谱技术,鉴定出两例国内首次发现的菌种。 一例是在血流感染(败血症和菌血症)患者血培养中分离出的Rothia aeria。该菌2004年从俄罗斯空间站的水和空气中被首次分离和鉴定,并由此命名,迄今为止很少引起人类感染,全球共6例报道,此例在国内为首例报道。另一例是在尿路感染患者尿液中,分离鉴定出Candida niva
中国科学报 - 菌种,宣武医院,败血症,菌血症,尿路感染 - 2014-02-14
我国完成首例中东呼吸综合征(MERS)病例病毒全基因组序列测定
6月3日凌晨,采用高通量测序方法,完成了全基因组序列测定,并于当天上传至美国国家生物技术信息中心(GenBank)数据库。序列分析结果表明,该
MedSci原创 - MERS,中东呼吸综合征,全基因组 - 2015-06-06
Br J Haematol:急性早幼粒白血病新致病基因GTF2I-RARA被发现
据了解,该融合基因全长1797个碱基对,共编码598个氨基酸,已注册美国生物信息中心GenBank数据库,同
MedSci原创 - 白血病,基因 - 2014-12-20
Eur J Med Res:抗药性念珠菌菌株的出现需要在决定用药方案之前进行抗真菌药敏试验
通过常规方法鉴定了分离的念珠菌菌株,并通过内部转录间隔区(ITS)测序进行了确认,并通过GenBank中的参考菌株进行了系统发育分析。另外,通过盘扩散法评估了不同念珠菌菌株对常用抗真菌剂的敏感性。
网络 - 2020-02-23
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