单细胞测序应用及技术实例
作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比,单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确,而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA,其优势是全方位和多层次的。与此同时,测序巨头相继推出新一代测序仪,为单细胞测序提供利器,越来越多与单细胞测序有关的研究也发表在顶级期刊上,这些都表明,单细胞测序已逐渐成为科研热点。单细胞测序应用及技术实例单
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2017-03-07
Science:单细胞测序细分肿瘤亚型
美国麻省总院和Broad研究所合作发表在3月31日Science杂志上对两种脑肿瘤亚型的详细分析显示,它们起源于神经祖细胞的相同类型,由基因突变模式和其微环境的组成分而区分开。
生物探索 - 肿瘤,单细胞测序 - 2017-04-04
Nature:如何利用单细胞mRNA测序发现罕见细胞类型?
近日,来自荷兰的科学家在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展,他们利用一种新的计算方法结合转录组测序发现了小肠中一些罕见的细胞类型,这对于深入了解器官的细胞组成,探究健康和疾病状态下的组织生物学具有重要意义理解一个器官的发育和功能需要对组成该器官的所有细胞类型的特性有一个清晰的认识。传统发现认为分离细胞亚群的方法是基于几个已知的标记基因表达出来的信使RNA或蛋白质实现
生物谷 - 单细胞mRNA,罕见细胞类型,Reg4,Lgr5 - 2015-08-25
Cell:革命性单细胞研究工具CellHint,可自动化整合多种人类单细胞图谱数据集
研究团队报道了最新开发的变革性工具—CellHint,这是一种基于预测聚类树(PCT)的工具,可解决数据集之间在注释分辨率和技术偏差方面的细胞类型差异。
测序中国 - CellHint,单细胞图谱 - 2024-01-25
单细胞研究指南:测序方法大比拼
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这些问题曾经是单细胞
Ebiotrade - 单细胞,测序方法 - 2016-05-18
从单细胞到多细胞只是一个小飞跃
多细胞动物进化图 图片来源:SEBé-PEDRóS ET AT 约8亿年前,第一个动物从其单细胞祖先进化而来。但新证据显示,从单细胞到多细胞生物的飞跃,在生命进化树上似乎不像科学家之前预想的那样戏剧性。近日,在刊登于《发育细胞学》期刊的论文中,研究人员表示,动物的单细胞祖先,似乎已经有了一些当前动物细胞发育成不同类型组织使用的机能。 “我们正在寻找对所有动物起源
发育细胞学 - 单细胞 - 2016-10-31
Nat Commun:单细胞测序揭示心肌细胞成熟机制
心肌细胞(CMs)是一种不同于心脏其他类型细胞的终末分化细胞,其不具备修复疾病或其他因素引起的心肌损伤的增殖能力。因此,重塑受损的心肌细胞仍是治疗如心肌梗死在内的心脏损伤性疾病的主要挑战。
MedSci原创 - 心肌细胞,单细胞RNA测序 - 2020-06-03
SCIENCE:单细胞转录组揭示人肾肿瘤的细胞身份
信使RNA编码细胞功能和表型。在人类癌症的背景下,它定义了恶性细胞的身份和肿瘤组织的多样性。
MedSci原创 - 肾脏,肿瘤,单细胞测序 - 2018-08-12
单细胞测序的方法和应用
单细胞测序的应用过去二十几年里,随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展,基因组研究日渐被 推向高潮。然而,迄今为止使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合DNA样本。这种方法能够得到全基因组序列信息,但是对其进行研究得到的结 果只是一群细胞中信号的平均值,或者只代表其中占优势数量的细胞信息,单个细胞独有的特性
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2014-04-06
单细胞转录组研究进展
单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战
生物化学与生物物理学进展 - 转录组,单细胞转录组 - 2014-01-03
单细胞RNA测序--TargetAmp法、SMART法
TargetAmp法测单细胞全RNA Illumina旗下的EpiCentre公司开发的TargetAmp方法,可以把少量RNA(最少到1个细胞,约10pg)扩增到ng级,以达到可以进行高通量测序所需的核酸量
陈巍学基因 - 单细胞测序,SMART - 2014-04-06
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